Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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