Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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