Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms