Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT140Q96RY7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms