Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRNP3Q8WYN3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms