Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSR1Q2NL82 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms