Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NBR1Q14596 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms