Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms