Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms