Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFNP31947 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFNP31947 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFNP31947 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFNP31947 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFNP31947 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFNP31947 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFNP31947 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms