Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms