Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms