Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BRAFP15056 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BRAFP15056 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BRAFP15056 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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