Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 Z95114.2-201ENST00000623490 2205 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms