Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM228BP0C875 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms