Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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