Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB3P05106 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB3P05106 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms