Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms