Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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