Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SETD2Q9BYW2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 AP001180.4-201ENST00000584167 823 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SETD2Q9BYW2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms