Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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HDAC8Q9BY41 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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HDAC8Q9BY41 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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HDAC8Q9BY41 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDAC8Q9BY41 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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