Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MCMBPQ9BTE3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms