Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC004990.1-202ENST00000454234 1965 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CYP2C19-201ENST00000371321 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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