Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms