Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SYT9Q86SS6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SYT9Q86SS6 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SYT9Q86SS6 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SYT9Q86SS6 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SYT9Q86SS6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYT9Q86SS6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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