Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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