Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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