Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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