Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms