Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALD1Q05682 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms