Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL3P58872 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms