Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIRAP54198 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms