Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA4P51532 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms