Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRE11P49959 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRE11P49959 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRE11P49959 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRE11P49959 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MRE11P49959 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MRE11P49959 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRE11P49959 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRE11P49959 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRE11P49959 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRE11P49959 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRE11P49959 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRE11P49959 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRE11P49959 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRE11P49959 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms