Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTDSS1P48651 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms