Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP2P32456 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBP2P32456 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms