Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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HOXD10P28358 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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HOXD10P28358 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXD10P28358 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXD10P28358 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXD10P28358 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXD10P28358 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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