Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms