Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms