Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms