Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SCN2BO60939 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SCN2BO60939 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SCN2BO60939 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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