Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms