Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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C4orf47A7E2U8 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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