Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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