Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms