Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms