Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms