Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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