Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms