Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC6Q8IVU3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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